Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMPD1P17405 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMPD1P17405 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms