Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOT1P17174 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GOT1P17174 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOT1P17174 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOT1P17174 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOT1P17174 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOT1P17174 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOT1P17174 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOT1P17174 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOT1P17174 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOT1P17174 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOT1P17174 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOT1P17174 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOT1P17174 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOT1P17174 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOT1P17174 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GOT1P17174 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOT1P17174 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOT1P17174 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOT1P17174 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GOT1P17174 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GOT1P17174 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOT1P17174 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOT1P17174 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOT1P17174 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOT1P17174 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOT1P17174 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOT1P17174 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOT1P17174 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOT1P17174 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOT1P17174 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOT1P17174 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOT1P17174 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOT1P17174 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GOT1P17174 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOT1P17174 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOT1P17174 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GOT1P17174 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOT1P17174 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOT1P17174 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOT1P17174 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOT1P17174 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GOT1P17174 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GOT1P17174 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GOT1P17174 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GOT1P17174 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GOT1P17174 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOT1P17174 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOT1P17174 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOT1P17174 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOT1P17174 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOT1P17174 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GOT1P17174 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOT1P17174 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOT1P17174 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOT1P17174 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOT1P17174 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOT1P17174 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOT1P17174 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOT1P17174 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOT1P17174 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOT1P17174 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOT1P17174 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOT1P17174 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOT1P17174 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOT1P17174 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GOT1P17174 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOT1P17174 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOT1P17174 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOT1P17174 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOT1P17174 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOT1P17174 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOT1P17174 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOT1P17174 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOT1P17174 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOT1P17174 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOT1P17174 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOT1P17174 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOT1P17174 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOT1P17174 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOT1P17174 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOT1P17174 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOT1P17174 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOT1P17174 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOT1P17174 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOT1P17174 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOT1P17174 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GOT1P17174 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GOT1P17174 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOT1P17174 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOT1P17174 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOT1P17174 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOT1P17174 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOT1P17174 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOT1P17174 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOT1P17174 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOT1P17174 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOT1P17174 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOT1P17174 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOT1P17174 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms