Protein–RNA interactions for Protein: P17038

ZNF43, Zinc finger protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF43P17038 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZNF43P17038 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF43P17038 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF43P17038 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF43P17038 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF43P17038 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF43P17038 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF43P17038 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF43P17038 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF43P17038 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF43P17038 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF43P17038 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF43P17038 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF43P17038 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF43P17038 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF43P17038 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF43P17038 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF43P17038 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF43P17038 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF43P17038 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF43P17038 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF43P17038 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF43P17038 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF43P17038 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF43P17038 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF43P17038 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF43P17038 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF43P17038 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF43P17038 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF43P17038 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF43P17038 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF43P17038 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF43P17038 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF43P17038 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF43P17038 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF43P17038 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF43P17038 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF43P17038 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF43P17038 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF43P17038 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF43P17038 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF43P17038 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF43P17038 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms