Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2A2P16615 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms