Protein–RNA interactions for Protein: P15884

TCF4, Transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4P15884 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF4P15884 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF4P15884 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF4P15884 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF4P15884 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF4P15884 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF4P15884 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF4P15884 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF4P15884 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF4P15884 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF4P15884 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF4P15884 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF4P15884 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF4P15884 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF4P15884 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF4P15884 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF4P15884 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF4P15884 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF4P15884 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF4P15884 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF4P15884 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF4P15884 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF4P15884 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF4P15884 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF4P15884 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF4P15884 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF4P15884 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF4P15884 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF4P15884 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF4P15884 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF4P15884 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF4P15884 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF4P15884 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF4P15884 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF4P15884 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF4P15884 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF4P15884 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF4P15884 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF4P15884 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF4P15884 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF4P15884 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF4P15884 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF4P15884 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF4P15884 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF4P15884 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF4P15884 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF4P15884 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF4P15884 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF4P15884 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF4P15884 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF4P15884 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF4P15884 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF4P15884 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF4P15884 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF4P15884 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF4P15884 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF4P15884 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF4P15884 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF4P15884 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF4P15884 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF4P15884 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF4P15884 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF4P15884 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF4P15884 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF4P15884 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF4P15884 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF4P15884 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF4P15884 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF4P15884 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF4P15884 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF4P15884 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TCF4P15884 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TCF4P15884 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TCF4P15884 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TCF4P15884 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TCF4P15884 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF4P15884 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF4P15884 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF4P15884 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF4P15884 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF4P15884 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF4P15884 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF4P15884 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF4P15884 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF4P15884 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF4P15884 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF4P15884 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF4P15884 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF4P15884 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF4P15884 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF4P15884 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF4P15884 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF4P15884 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF4P15884 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF4P15884 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF4P15884 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF4P15884 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF4P15884 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF4P15884 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF4P15884 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms