Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CFTRP13569 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CFTRP13569 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CFTRP13569 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CFTRP13569 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CFTRP13569 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CFTRP13569 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CFTRP13569 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CFTRP13569 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CFTRP13569 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CFTRP13569 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
CFTRP13569 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CFTRP13569 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CFTRP13569 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CFTRP13569 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CFTRP13569 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CFTRP13569 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CFTRP13569 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CFTRP13569 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CFTRP13569 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CFTRP13569 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CFTRP13569 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CFTRP13569 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CFTRP13569 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CFTRP13569 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CFTRP13569 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
CFTRP13569 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
CFTRP13569 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
CFTRP13569 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
CFTRP13569 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
CFTRP13569 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
CFTRP13569 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CFTRP13569 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CFTRP13569 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CFTRP13569 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
CFTRP13569 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
CFTRP13569 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CFTRP13569 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CFTRP13569 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CFTRP13569 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CFTRP13569 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CFTRP13569 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CFTRP13569 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CFTRP13569 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CFTRP13569 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CFTRP13569 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CFTRP13569 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CFTRP13569 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CFTRP13569 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CFTRP13569 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CFTRP13569 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CFTRP13569 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CFTRP13569 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CFTRP13569 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CFTRP13569 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CFTRP13569 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CFTRP13569 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CFTRP13569 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CFTRP13569 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CFTRP13569 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CFTRP13569 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CFTRP13569 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CFTRP13569 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CFTRP13569 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CFTRP13569 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CFTRP13569 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CFTRP13569 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CFTRP13569 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CFTRP13569 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CFTRP13569 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
CFTRP13569 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CFTRP13569 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CFTRP13569 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CFTRP13569 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CFTRP13569 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CFTRP13569 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CFTRP13569 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CFTRP13569 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CFTRP13569 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CFTRP13569 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CFTRP13569 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CFTRP13569 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CFTRP13569 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CFTRP13569 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC37.2■■■■□ 3.54
CFTRP13569 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.54
CFTRP13569 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CFTRP13569 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CFTRP13569 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CFTRP13569 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CFTRP13569 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CFTRP13569 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CFTRP13569 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CFTRP13569 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CFTRP13569 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CFTRP13569 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CFTRP13569 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CFTRP13569 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CFTRP13569 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
CFTRP13569 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CFTRP13569 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms