Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RLBP1P12271 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms