Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT3P12035 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT3P12035 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT3P12035 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT3P12035 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT3P12035 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT3P12035 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT3P12035 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT3P12035 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT3P12035 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT3P12035 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT3P12035 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT3P12035 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT3P12035 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT3P12035 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT3P12035 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT3P12035 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT3P12035 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT3P12035 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT3P12035 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT3P12035 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT3P12035 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT3P12035 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT3P12035 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT3P12035 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT3P12035 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT3P12035 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT3P12035 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT3P12035 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT3P12035 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT3P12035 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT3P12035 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT3P12035 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT3P12035 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT3P12035 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT3P12035 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT3P12035 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT3P12035 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT3P12035 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT3P12035 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT3P12035 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT3P12035 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT3P12035 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT3P12035 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT3P12035 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT3P12035 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT3P12035 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT3P12035 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT3P12035 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT3P12035 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT3P12035 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT3P12035 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT3P12035 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT3P12035 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT3P12035 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT3P12035 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT3P12035 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT3P12035 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT3P12035 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT3P12035 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT3P12035 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT3P12035 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT3P12035 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT3P12035 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT3P12035 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT3P12035 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT3P12035 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT3P12035 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT3P12035 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT3P12035 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT3P12035 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT3P12035 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT3P12035 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT3P12035 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT3P12035 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT3P12035 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT3P12035 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT3P12035 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT3P12035 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT3P12035 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT3P12035 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT3P12035 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT3P12035 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT3P12035 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT3P12035 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT3P12035 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT3P12035 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT3P12035 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT3P12035 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT3P12035 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT3P12035 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT3P12035 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT3P12035 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT3P12035 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT3P12035 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT3P12035 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT3P12035 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT3P12035 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT3P12035 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT3P12035 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms