Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DMDP11532 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DMDP11532 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DMDP11532 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DMDP11532 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DMDP11532 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DMDP11532 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DMDP11532 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DMDP11532 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DMDP11532 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DMDP11532 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DMDP11532 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DMDP11532 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DMDP11532 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DMDP11532 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DMDP11532 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DMDP11532 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DMDP11532 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DMDP11532 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DMDP11532 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DMDP11532 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DMDP11532 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DMDP11532 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DMDP11532 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DMDP11532 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DMDP11532 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DMDP11532 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DMDP11532 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DMDP11532 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DMDP11532 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DMDP11532 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DMDP11532 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DMDP11532 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DMDP11532 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DMDP11532 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DMDP11532 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DMDP11532 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DMDP11532 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DMDP11532 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DMDP11532 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DMDP11532 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DMDP11532 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DMDP11532 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DMDP11532 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DMDP11532 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DMDP11532 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DMDP11532 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DMDP11532 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DMDP11532 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DMDP11532 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DMDP11532 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DMDP11532 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DMDP11532 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DMDP11532 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DMDP11532 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DMDP11532 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DMDP11532 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DMDP11532 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DMDP11532 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DMDP11532 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DMDP11532 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DMDP11532 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DMDP11532 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DMDP11532 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DMDP11532 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DMDP11532 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DMDP11532 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DMDP11532 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DMDP11532 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DMDP11532 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DMDP11532 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DMDP11532 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DMDP11532 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DMDP11532 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DMDP11532 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DMDP11532 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DMDP11532 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DMDP11532 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DMDP11532 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DMDP11532 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DMDP11532 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DMDP11532 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DMDP11532 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DMDP11532 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DMDP11532 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DMDP11532 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DMDP11532 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DMDP11532 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DMDP11532 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DMDP11532 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DMDP11532 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DMDP11532 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DMDP11532 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DMDP11532 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DMDP11532 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DMDP11532 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DMDP11532 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DMDP11532 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DMDP11532 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DMDP11532 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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