Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RALAP11233 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RALAP11233 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RALAP11233 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RALAP11233 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RALAP11233 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RALAP11233 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RALAP11233 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RALAP11233 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RALAP11233 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RALAP11233 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RALAP11233 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RALAP11233 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RALAP11233 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RALAP11233 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RALAP11233 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RALAP11233 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RALAP11233 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RALAP11233 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RALAP11233 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RALAP11233 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RALAP11233 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RALAP11233 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RALAP11233 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RALAP11233 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RALAP11233 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RALAP11233 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RALAP11233 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RALAP11233 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RALAP11233 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RALAP11233 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RALAP11233 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RALAP11233 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RALAP11233 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RALAP11233 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RALAP11233 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RALAP11233 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RALAP11233 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RALAP11233 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RALAP11233 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RALAP11233 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RALAP11233 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RALAP11233 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RALAP11233 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RALAP11233 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RALAP11233 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RALAP11233 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RALAP11233 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RALAP11233 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RALAP11233 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RALAP11233 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RALAP11233 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RALAP11233 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RALAP11233 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RALAP11233 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RALAP11233 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RALAP11233 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RALAP11233 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RALAP11233 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RALAP11233 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RALAP11233 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RALAP11233 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RALAP11233 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RALAP11233 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RALAP11233 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RALAP11233 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RALAP11233 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RALAP11233 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RALAP11233 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RALAP11233 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RALAP11233 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RALAP11233 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RALAP11233 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RALAP11233 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RALAP11233 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RALAP11233 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RALAP11233 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RALAP11233 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RALAP11233 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RALAP11233 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RALAP11233 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RALAP11233 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RALAP11233 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RALAP11233 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RALAP11233 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RALAP11233 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RALAP11233 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RALAP11233 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RALAP11233 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RALAP11233 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RALAP11233 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RALAP11233 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RALAP11233 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RALAP11233 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RALAP11233 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RALAP11233 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RALAP11233 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RALAP11233 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RALAP11233 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RALAP11233 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms