Protein–RNA interactions for Protein: P10276

RARA, Retinoic acid receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARAP10276 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARAP10276 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARAP10276 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARAP10276 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARAP10276 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARAP10276 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARAP10276 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARAP10276 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARAP10276 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARAP10276 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARAP10276 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RARAP10276 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARAP10276 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARAP10276 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARAP10276 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARAP10276 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RARAP10276 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARAP10276 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARAP10276 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RARAP10276 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARAP10276 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARAP10276 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARAP10276 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARAP10276 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARAP10276 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARAP10276 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARAP10276 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARAP10276 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARAP10276 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARAP10276 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARAP10276 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARAP10276 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARAP10276 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARAP10276 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARAP10276 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARAP10276 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RARAP10276 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RARAP10276 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARAP10276 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RARAP10276 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARAP10276 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARAP10276 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARAP10276 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARAP10276 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARAP10276 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARAP10276 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARAP10276 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARAP10276 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARAP10276 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARAP10276 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARAP10276 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARAP10276 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARAP10276 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARAP10276 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARAP10276 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARAP10276 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARAP10276 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARAP10276 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARAP10276 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARAP10276 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARAP10276 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARAP10276 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARAP10276 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARAP10276 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARAP10276 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARAP10276 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARAP10276 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RARAP10276 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARAP10276 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARAP10276 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARAP10276 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARAP10276 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RARAP10276 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARAP10276 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARAP10276 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARAP10276 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARAP10276 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARAP10276 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARAP10276 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARAP10276 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARAP10276 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARAP10276 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARAP10276 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARAP10276 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARAP10276 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARAP10276 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARAP10276 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARAP10276 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARAP10276 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARAP10276 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARAP10276 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RARAP10276 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARAP10276 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARAP10276 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARAP10276 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARAP10276 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RARAP10276 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RARAP10276 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RARAP10276 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RARAP10276 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms