Protein–RNA interactions for Protein: P0CX85

RPL35B, 60S ribosomal protein L35-B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPL35BP0CX85 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.83□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.83□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.83□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 PDC2YDR081C 2778 nt2.83□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 SMT3YDR510W 306 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 SPT2YER161C 1002 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 YGR273CYGR273C 525 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 ARD1YHR013C 717 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 ILV5YLR355C 1188 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 INN1YNL152W 1230 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 MED7YOL135C 669 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 snR42snR42 351 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 PHO81YGR233C 3537 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 NET1YJL076W 3570 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 VPS3YDR495C 3036 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 MIP6YHR015W 1980 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 SMC2YFR031C 3513 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 MET5YJR137C 4329 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 STU2YLR045C 2667 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 CIN1YOR349W 3045 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 YGR026WYGR026W 837 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 AGE2YIL044C 897 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 YKL071WYKL071W 771 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 YKL091CYKL091C 933 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 SDS23YGL056C 1584 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 ARG5,6YER069W 2592 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 YPR022CYPR022C 3402 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 SIN4YNL236W 2925 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 RAD7YJR052W 1698 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 KRE2YDR483W 1329 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 RTT109YLL002W 1311 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 CGR1YGL029W 363 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 TOM20YGR082W 552 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 COX23YHR116W 456 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 BET1YIL004C 429 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 ENV10YLR065C 546 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 HUB1YNR032C-A 222 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 NIP7YPL211W 546 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 YBR096WYBR096W 693 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 ITC1YGL133W 3795 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 YDL176WYDL176W 2127 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 CIN8YEL061C 3003 nt2.79□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 MTL1YGR023W 1656 nt2.79□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 BMS1YPL217C 3552 nt2.79□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 GRX3YDR098C 858 nt2.79□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 NKP1YDR383C 717 nt2.79□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 DYN2YDR424C 279 nt2.79□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 AML1YGR001C 747 nt2.79□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 YIL025CYIL025C 375 nt2.79□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 RPS11BYBR048W 471 nt2.79□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 CIK1YMR198W 1785 nt2.79□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 MGR3YMR115W 1506 nt2.78□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 KTR6YPL053C 1341 nt2.78□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 YDR193WYDR193W 399 nt2.78□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt2.78□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 GOT1YMR292W 417 nt2.78□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 SSM4YIL030C 3960 nt2.78□□□□□ -1.96
RPL35BP0CX85 NOP4YPL043W 2058 nt2.77□□□□□ -1.97
RPL35BP0CX85 TOM1YDR457W 9807 nt2.77□□□□□ -1.97
RPL35BP0CX85 BSC2YDR275W 708 nt2.77□□□□□ -1.97
RPL35BP0CX85 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.77□□□□□ -1.97
RPL35BP0CX85 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.77□□□□□ -1.97
RPL35BP0CX85 YHR180WYHR180W 492 nt2.77□□□□□ -1.97
RPL35BP0CX85 PKH1YDR490C 2301 nt2.77□□□□□ -1.97
RPL35BP0CX85 DNM1YLL001W 2274 nt2.77□□□□□ -1.97
RPL35BP0CX85 MET6YER091C 2304 nt2.76□□□□□ -1.97
RPL35BP0CX85 HOS2YGL194C 1359 nt2.76□□□□□ -1.97
RPL35BP0CX85 CTK1YKL139W 1587 nt2.76□□□□□ -1.97
RPL35BP0CX85 APC9YLR102C 798 nt2.76□□□□□ -1.97
RPL35BP0CX85 YOR082CYOR082C 342 nt2.76□□□□□ -1.97
RPL35BP0CX85 MPD1YOR288C 957 nt2.76□□□□□ -1.97
RPL35BP0CX85 TRM1YDR120C 1713 nt2.76□□□□□ -1.97
RPL35BP0CX85 YPL109CYPL109C 1974 nt2.76□□□□□ -1.97
RPL35BP0CX85 PSK1YAL017W 4071 nt2.75□□□□□ -1.97
RPL35BP0CX85 SEC59YMR013C 1560 nt2.75□□□□□ -1.97
RPL35BP0CX85 KAP104YBR017C 2757 nt2.75□□□□□ -1.97
RPL35BP0CX85 DET1YDR051C 1005 nt2.75□□□□□ -1.97
RPL35BP0CX85 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.75□□□□□ -1.97
RPL35BP0CX85 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.75□□□□□ -1.97
RPL35BP0CX85 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.75□□□□□ -1.97
RPL35BP0CX85 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.75□□□□□ -1.97
RPL35BP0CX85 GRX2YDR513W 432 nt2.75□□□□□ -1.97
RPL35BP0CX85 MRPS35YGR165W 1038 nt2.75□□□□□ -1.97
RPL35BP0CX85 RNH203YLR154C 333 nt2.75□□□□□ -1.97
RPL35BP0CX85 NDL1YLR254C 570 nt2.75□□□□□ -1.97
RPL35BP0CX85 RAD33YML011C 534 nt2.75□□□□□ -1.97
RPL35BP0CX85 AAR2YBL074C 1068 nt2.75□□□□□ -1.97
RPL35BP0CX85 RPA43YOR340C 981 nt2.75□□□□□ -1.97
RPL35BP0CX85 YPR027CYPR027C 834 nt2.75□□□□□ -1.97
RPL35BP0CX85 YMR1YJR110W 2067 nt2.74□□□□□ -1.97
RPL35BP0CX85 DTD1YDL219W 453 nt2.74□□□□□ -1.97
RPL35BP0CX85 CDC26YFR036W 375 nt2.74□□□□□ -1.97
RPL35BP0CX85 AHP1YLR109W 531 nt2.74□□□□□ -1.97
RPL35BP0CX85 YNL109WYNL109W 546 nt2.74□□□□□ -1.97
RPL35BP0CX85 AAH1YNL141W 1044 nt2.74□□□□□ -1.97
RPL35BP0CX85 YBL077WYBL077W 432 nt2.74□□□□□ -1.97
RPL35BP0CX85 AIM39YOL053W 1188 nt2.74□□□□□ -1.97
RPL35BP0CX85 PNT1YOR266W 1272 nt2.74□□□□□ -1.97
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