Protein–RNA interactions for Protein: P0CG47

UBB, Polyubiquitin-B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBBP0CG47 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.5 ms