Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
POLA1P09884 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
POLA1P09884 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
POLA1P09884 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
POLA1P09884 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
POLA1P09884 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
POLA1P09884 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
POLA1P09884 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
POLA1P09884 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
POLA1P09884 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
POLA1P09884 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
POLA1P09884 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
POLA1P09884 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
POLA1P09884 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
POLA1P09884 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
POLA1P09884 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
POLA1P09884 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
POLA1P09884 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC36.17■■■■□ 3.38
POLA1P09884 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
POLA1P09884 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
POLA1P09884 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
POLA1P09884 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
POLA1P09884 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
POLA1P09884 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
POLA1P09884 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
POLA1P09884 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
POLA1P09884 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
POLA1P09884 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
POLA1P09884 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
POLA1P09884 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
POLA1P09884 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
POLA1P09884 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
POLA1P09884 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
POLA1P09884 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
POLA1P09884 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
POLA1P09884 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
POLA1P09884 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
POLA1P09884 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
POLA1P09884 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
POLA1P09884 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
POLA1P09884 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
POLA1P09884 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
POLA1P09884 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
POLA1P09884 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
POLA1P09884 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
POLA1P09884 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
POLA1P09884 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
POLA1P09884 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
POLA1P09884 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
POLA1P09884 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC36.13■■■■□ 3.37
POLA1P09884 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
POLA1P09884 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
POLA1P09884 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
POLA1P09884 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
POLA1P09884 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
POLA1P09884 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
POLA1P09884 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
POLA1P09884 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
POLA1P09884 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
POLA1P09884 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
POLA1P09884 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
POLA1P09884 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
POLA1P09884 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
POLA1P09884 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
POLA1P09884 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
POLA1P09884 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
POLA1P09884 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
POLA1P09884 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
POLA1P09884 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
POLA1P09884 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
POLA1P09884 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
POLA1P09884 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
POLA1P09884 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
POLA1P09884 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
POLA1P09884 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
POLA1P09884 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC36.11■■■■□ 3.37
POLA1P09884 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
POLA1P09884 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
POLA1P09884 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
POLA1P09884 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
POLA1P09884 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
POLA1P09884 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
POLA1P09884 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
POLA1P09884 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
POLA1P09884 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
POLA1P09884 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
POLA1P09884 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
POLA1P09884 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
POLA1P09884 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
POLA1P09884 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
POLA1P09884 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
POLA1P09884 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
POLA1P09884 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
POLA1P09884 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
POLA1P09884 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
POLA1P09884 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
POLA1P09884 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
POLA1P09884 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
POLA1P09884 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
POLA1P09884 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms