Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB3P05106 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms