Protein–RNA interactions for Protein: P05023

ATP1A1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A1P05023 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP1A1P05023 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1A1P05023 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1A1P05023 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1A1P05023 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1A1P05023 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1A1P05023 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1A1P05023 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1A1P05023 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1A1P05023 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP1A1P05023 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP1A1P05023 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP1A1P05023 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP1A1P05023 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP1A1P05023 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP1A1P05023 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP1A1P05023 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP1A1P05023 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A1P05023 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A1P05023 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A1P05023 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A1P05023 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A1P05023 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A1P05023 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A1P05023 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A1P05023 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A1P05023 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A1P05023 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A1P05023 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A1P05023 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A1P05023 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A1P05023 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A1P05023 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A1P05023 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A1P05023 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms