Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOEP02649 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOEP02649 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOEP02649 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOEP02649 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOEP02649 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOEP02649 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOEP02649 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOEP02649 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOEP02649 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOEP02649 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOEP02649 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOEP02649 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOEP02649 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOEP02649 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOEP02649 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOEP02649 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOEP02649 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOEP02649 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APOEP02649 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOEP02649 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOEP02649 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOEP02649 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOEP02649 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOEP02649 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOEP02649 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOEP02649 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOEP02649 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOEP02649 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOEP02649 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOEP02649 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOEP02649 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOEP02649 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOEP02649 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOEP02649 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
APOEP02649 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOEP02649 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOEP02649 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOEP02649 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOEP02649 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOEP02649 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOEP02649 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOEP02649 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOEP02649 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOEP02649 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOEP02649 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOEP02649 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOEP02649 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
APOEP02649 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
APOEP02649 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOEP02649 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOEP02649 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOEP02649 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
APOEP02649 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOEP02649 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOEP02649 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOEP02649 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOEP02649 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOEP02649 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOEP02649 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
APOEP02649 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOEP02649 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
APOEP02649 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOEP02649 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOEP02649 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOEP02649 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOEP02649 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOEP02649 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOEP02649 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOEP02649 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOEP02649 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOEP02649 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOEP02649 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOEP02649 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOEP02649 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOEP02649 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOEP02649 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOEP02649 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOEP02649 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOEP02649 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOEP02649 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
APOEP02649 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOEP02649 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
APOEP02649 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOEP02649 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOEP02649 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOEP02649 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOEP02649 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOEP02649 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOEP02649 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOEP02649 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOEP02649 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOEP02649 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOEP02649 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOEP02649 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
APOEP02649 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOEP02649 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOEP02649 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOEP02649 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOEP02649 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms