Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX58O95786 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX58O95786 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX58O95786 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX58O95786 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX58O95786 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX58O95786 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX58O95786 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX58O95786 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX58O95786 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX58O95786 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX58O95786 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX58O95786 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX58O95786 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX58O95786 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX58O95786 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX58O95786 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX58O95786 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX58O95786 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX58O95786 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX58O95786 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX58O95786 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX58O95786 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX58O95786 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX58O95786 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX58O95786 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX58O95786 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX58O95786 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX58O95786 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX58O95786 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX58O95786 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX58O95786 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX58O95786 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX58O95786 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX58O95786 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX58O95786 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX58O95786 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX58O95786 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX58O95786 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX58O95786 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX58O95786 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX58O95786 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX58O95786 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX58O95786 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX58O95786 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX58O95786 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX58O95786 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX58O95786 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX58O95786 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX58O95786 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX58O95786 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX58O95786 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX58O95786 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX58O95786 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX58O95786 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX58O95786 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX58O95786 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX58O95786 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX58O95786 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX58O95786 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX58O95786 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX58O95786 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX58O95786 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
DDX58O95786 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX58O95786 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX58O95786 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX58O95786 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX58O95786 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX58O95786 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX58O95786 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX58O95786 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX58O95786 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX58O95786 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX58O95786 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX58O95786 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX58O95786 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX58O95786 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX58O95786 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX58O95786 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX58O95786 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX58O95786 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX58O95786 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX58O95786 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX58O95786 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX58O95786 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX58O95786 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX58O95786 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX58O95786 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX58O95786 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX58O95786 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX58O95786 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX58O95786 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX58O95786 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX58O95786 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX58O95786 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX58O95786 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX58O95786 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX58O95786 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX58O95786 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX58O95786 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms