Protein–RNA interactions for Protein: O94972

TRIM37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM37O94972 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM37O94972 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM37O94972 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM37O94972 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM37O94972 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM37O94972 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM37O94972 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM37O94972 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM37O94972 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM37O94972 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM37O94972 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM37O94972 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM37O94972 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM37O94972 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM37O94972 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM37O94972 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM37O94972 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM37O94972 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM37O94972 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM37O94972 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM37O94972 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM37O94972 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM37O94972 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM37O94972 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM37O94972 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms