Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRPF6O94906 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms