Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPM3O75607 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPM3O75607 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NPM3O75607 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NPM3O75607 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NPM3O75607 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NPM3O75607 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NPM3O75607 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NPM3O75607 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NPM3O75607 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NPM3O75607 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NPM3O75607 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NPM3O75607 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NPM3O75607 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPM3O75607 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPM3O75607 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPM3O75607 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPM3O75607 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPM3O75607 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPM3O75607 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPM3O75607 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPM3O75607 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPM3O75607 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPM3O75607 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPM3O75607 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPM3O75607 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPM3O75607 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPM3O75607 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPM3O75607 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPM3O75607 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPM3O75607 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPM3O75607 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPM3O75607 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPM3O75607 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPM3O75607 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NPM3O75607 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPM3O75607 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPM3O75607 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPM3O75607 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPM3O75607 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPM3O75607 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPM3O75607 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPM3O75607 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPM3O75607 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPM3O75607 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPM3O75607 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPM3O75607 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPM3O75607 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NPM3O75607 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NPM3O75607 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NPM3O75607 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NPM3O75607 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NPM3O75607 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NPM3O75607 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NPM3O75607 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NPM3O75607 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NPM3O75607 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NPM3O75607 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NPM3O75607 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NPM3O75607 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NPM3O75607 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NPM3O75607 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPM3O75607 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPM3O75607 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPM3O75607 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPM3O75607 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NPM3O75607 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPM3O75607 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NPM3O75607 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPM3O75607 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPM3O75607 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPM3O75607 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPM3O75607 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPM3O75607 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPM3O75607 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPM3O75607 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPM3O75607 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPM3O75607 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPM3O75607 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPM3O75607 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPM3O75607 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPM3O75607 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPM3O75607 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPM3O75607 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPM3O75607 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPM3O75607 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPM3O75607 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPM3O75607 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NPM3O75607 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPM3O75607 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NPM3O75607 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NPM3O75607 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPM3O75607 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPM3O75607 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPM3O75607 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPM3O75607 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPM3O75607 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPM3O75607 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPM3O75607 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPM3O75607 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms