Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms