Protein–RNA interactions for Protein: O75446

SAP30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP30O75446 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAP30O75446 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAP30O75446 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAP30O75446 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAP30O75446 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAP30O75446 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAP30O75446 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAP30O75446 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAP30O75446 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAP30O75446 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAP30O75446 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAP30O75446 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAP30O75446 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAP30O75446 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAP30O75446 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAP30O75446 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAP30O75446 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAP30O75446 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAP30O75446 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SAP30O75446 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAP30O75446 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAP30O75446 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAP30O75446 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAP30O75446 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAP30O75446 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAP30O75446 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAP30O75446 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAP30O75446 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SAP30O75446 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAP30O75446 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAP30O75446 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAP30O75446 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SAP30O75446 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAP30O75446 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAP30O75446 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAP30O75446 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAP30O75446 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAP30O75446 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAP30O75446 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAP30O75446 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAP30O75446 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAP30O75446 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SAP30O75446 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SAP30O75446 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAP30O75446 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAP30O75446 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAP30O75446 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAP30O75446 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAP30O75446 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SAP30O75446 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAP30O75446 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAP30O75446 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAP30O75446 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAP30O75446 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAP30O75446 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAP30O75446 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAP30O75446 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAP30O75446 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAP30O75446 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAP30O75446 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAP30O75446 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAP30O75446 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAP30O75446 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAP30O75446 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAP30O75446 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAP30O75446 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SAP30O75446 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAP30O75446 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAP30O75446 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAP30O75446 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAP30O75446 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAP30O75446 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAP30O75446 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAP30O75446 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAP30O75446 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAP30O75446 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAP30O75446 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAP30O75446 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAP30O75446 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAP30O75446 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAP30O75446 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAP30O75446 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAP30O75446 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAP30O75446 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAP30O75446 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAP30O75446 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAP30O75446 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAP30O75446 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SAP30O75446 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAP30O75446 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAP30O75446 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAP30O75446 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAP30O75446 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAP30O75446 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAP30O75446 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAP30O75446 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAP30O75446 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAP30O75446 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SAP30O75446 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAP30O75446 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms