Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PPFIA2O75334 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA2O75334 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms