Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF2O60811 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF2O60811 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF2O60811 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF2O60811 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF2O60811 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF2O60811 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF2O60811 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF2O60811 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF2O60811 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF2O60811 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF2O60811 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF2O60811 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF2O60811 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF2O60811 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF2O60811 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF2O60811 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF2O60811 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF2O60811 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF2O60811 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF2O60811 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF2O60811 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF2O60811 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF2O60811 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF2O60811 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF2O60811 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF2O60811 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF2O60811 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF2O60811 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF2O60811 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF2O60811 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF2O60811 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF2O60811 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF2O60811 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF2O60811 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF2O60811 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF2O60811 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF2O60811 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF2O60811 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF2O60811 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRAMEF2O60811 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms