Protein–RNA interactions for Protein: O60504

SORBS3, Vinexin, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORBS3O60504 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SORBS3O60504 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SORBS3O60504 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SORBS3O60504 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SORBS3O60504 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SORBS3O60504 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SORBS3O60504 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SORBS3O60504 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SORBS3O60504 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SORBS3O60504 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SORBS3O60504 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SORBS3O60504 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SORBS3O60504 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SORBS3O60504 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SORBS3O60504 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SORBS3O60504 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SORBS3O60504 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SORBS3O60504 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SORBS3O60504 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SORBS3O60504 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SORBS3O60504 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SORBS3O60504 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SORBS3O60504 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms