Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CXCL13O43927 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CXCL13O43927 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CXCL13O43927 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CXCL13O43927 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CXCL13O43927 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CXCL13O43927 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CXCL13O43927 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CXCL13O43927 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CXCL13O43927 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL13O43927 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL13O43927 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL13O43927 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms