Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXTL3O43909 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXTL3O43909 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms