Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP9BO43861 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms