Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EDIL3O43854 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDIL3O43854 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDIL3O43854 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDIL3O43854 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDIL3O43854 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDIL3O43854 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDIL3O43854 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDIL3O43854 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDIL3O43854 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDIL3O43854 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDIL3O43854 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDIL3O43854 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDIL3O43854 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDIL3O43854 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDIL3O43854 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDIL3O43854 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDIL3O43854 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDIL3O43854 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDIL3O43854 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDIL3O43854 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDIL3O43854 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDIL3O43854 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDIL3O43854 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDIL3O43854 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDIL3O43854 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDIL3O43854 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDIL3O43854 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDIL3O43854 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EDIL3O43854 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDIL3O43854 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms