Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HTATSF1O43719 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms