Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP2AO43633 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms