Protein–RNA interactions for Protein: O43615

TIMM44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44O43615 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMM44O43615 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM44O43615 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms