Protein–RNA interactions for Protein: O43612

HCRT, Orexin, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCRTO43612 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCRTO43612 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCRTO43612 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCRTO43612 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCRTO43612 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCRTO43612 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCRTO43612 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCRTO43612 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCRTO43612 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCRTO43612 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCRTO43612 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCRTO43612 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCRTO43612 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCRTO43612 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCRTO43612 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCRTO43612 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCRTO43612 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCRTO43612 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCRTO43612 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCRTO43612 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCRTO43612 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCRTO43612 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCRTO43612 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCRTO43612 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCRTO43612 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCRTO43612 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCRTO43612 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCRTO43612 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCRTO43612 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCRTO43612 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCRTO43612 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCRTO43612 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCRTO43612 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCRTO43612 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCRTO43612 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCRTO43612 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCRTO43612 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCRTO43612 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HCRTO43612 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCRTO43612 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCRTO43612 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCRTO43612 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCRTO43612 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCRTO43612 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCRTO43612 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCRTO43612 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCRTO43612 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCRTO43612 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCRTO43612 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HCRTO43612 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCRTO43612 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HCRTO43612 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCRTO43612 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCRTO43612 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCRTO43612 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCRTO43612 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCRTO43612 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCRTO43612 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCRTO43612 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCRTO43612 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCRTO43612 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCRTO43612 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HCRTO43612 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCRTO43612 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCRTO43612 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCRTO43612 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCRTO43612 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HCRTO43612 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCRTO43612 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCRTO43612 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCRTO43612 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCRTO43612 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCRTO43612 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCRTO43612 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCRTO43612 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCRTO43612 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCRTO43612 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCRTO43612 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCRTO43612 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCRTO43612 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCRTO43612 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCRTO43612 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCRTO43612 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCRTO43612 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCRTO43612 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCRTO43612 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HCRTO43612 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCRTO43612 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCRTO43612 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCRTO43612 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCRTO43612 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCRTO43612 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCRTO43612 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCRTO43612 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HCRTO43612 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCRTO43612 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCRTO43612 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCRTO43612 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCRTO43612 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HCRTO43612 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms