Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
SYNJ1O43426 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SYNJ1O43426 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms