Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSI1O43347 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSI1O43347 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSI1O43347 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSI1O43347 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSI1O43347 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSI1O43347 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSI1O43347 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSI1O43347 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSI1O43347 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSI1O43347 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSI1O43347 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSI1O43347 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MSI1O43347 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSI1O43347 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSI1O43347 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSI1O43347 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSI1O43347 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSI1O43347 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSI1O43347 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSI1O43347 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MSI1O43347 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSI1O43347 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSI1O43347 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MSI1O43347 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSI1O43347 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSI1O43347 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSI1O43347 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSI1O43347 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSI1O43347 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSI1O43347 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSI1O43347 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSI1O43347 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSI1O43347 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSI1O43347 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSI1O43347 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSI1O43347 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MSI1O43347 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSI1O43347 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSI1O43347 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSI1O43347 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MSI1O43347 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSI1O43347 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSI1O43347 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSI1O43347 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSI1O43347 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSI1O43347 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSI1O43347 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MSI1O43347 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSI1O43347 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSI1O43347 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSI1O43347 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSI1O43347 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSI1O43347 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSI1O43347 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSI1O43347 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSI1O43347 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSI1O43347 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSI1O43347 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MSI1O43347 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSI1O43347 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSI1O43347 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSI1O43347 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSI1O43347 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSI1O43347 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MSI1O43347 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSI1O43347 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSI1O43347 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSI1O43347 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSI1O43347 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSI1O43347 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSI1O43347 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSI1O43347 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSI1O43347 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSI1O43347 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSI1O43347 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSI1O43347 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSI1O43347 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSI1O43347 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSI1O43347 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSI1O43347 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSI1O43347 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSI1O43347 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSI1O43347 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSI1O43347 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MSI1O43347 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSI1O43347 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSI1O43347 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSI1O43347 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSI1O43347 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSI1O43347 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MSI1O43347 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MSI1O43347 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSI1O43347 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSI1O43347 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSI1O43347 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSI1O43347 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSI1O43347 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSI1O43347 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSI1O43347 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms