Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMA5O15230 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA5O15230 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms