Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms