Protein–RNA interactions for Protein: O00472

ELL2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL2O00472 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ELL2O00472 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ELL2O00472 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ELL2O00472 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ELL2O00472 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ELL2O00472 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ELL2O00472 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ELL2O00472 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ELL2O00472 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ELL2O00472 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ELL2O00472 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ELL2O00472 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ELL2O00472 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ELL2O00472 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ELL2O00472 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ELL2O00472 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ELL2O00472 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ELL2O00472 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ELL2O00472 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ELL2O00472 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ELL2O00472 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ELL2O00472 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ELL2O00472 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ELL2O00472 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ELL2O00472 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ELL2O00472 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ELL2O00472 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ELL2O00472 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ELL2O00472 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ELL2O00472 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ELL2O00472 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ELL2O00472 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ELL2O00472 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ELL2O00472 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ELL2O00472 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ELL2O00472 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ELL2O00472 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ELL2O00472 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ELL2O00472 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ELL2O00472 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ELL2O00472 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ELL2O00472 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ELL2O00472 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ELL2O00472 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ELL2O00472 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ELL2O00472 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ELL2O00472 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ELL2O00472 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ELL2O00472 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ELL2O00472 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ELL2O00472 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ELL2O00472 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ELL2O00472 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ELL2O00472 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ELL2O00472 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ELL2O00472 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ELL2O00472 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ELL2O00472 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ELL2O00472 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ELL2O00472 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ELL2O00472 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ELL2O00472 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ELL2O00472 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ELL2O00472 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ELL2O00472 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ELL2O00472 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ELL2O00472 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ELL2O00472 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ELL2O00472 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ELL2O00472 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ELL2O00472 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ELL2O00472 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ELL2O00472 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ELL2O00472 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ELL2O00472 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ELL2O00472 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ELL2O00472 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ELL2O00472 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ELL2O00472 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ELL2O00472 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ELL2O00472 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ELL2O00472 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ELL2O00472 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ELL2O00472 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ELL2O00472 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ELL2O00472 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ELL2O00472 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ELL2O00472 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ELL2O00472 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ELL2O00472 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ELL2O00472 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ELL2O00472 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ELL2O00472 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ELL2O00472 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ELL2O00472 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ELL2O00472 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ELL2O00472 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ELL2O00472 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ELL2O00472 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ELL2O00472 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms