Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGRNO00468 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGRNO00468 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGRNO00468 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGRNO00468 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGRNO00468 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGRNO00468 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGRNO00468 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGRNO00468 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGRNO00468 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGRNO00468 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGRNO00468 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGRNO00468 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGRNO00468 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGRNO00468 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGRNO00468 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGRNO00468 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGRNO00468 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGRNO00468 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGRNO00468 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGRNO00468 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGRNO00468 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGRNO00468 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGRNO00468 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGRNO00468 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGRNO00468 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGRNO00468 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AGRNO00468 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGRNO00468 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGRNO00468 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AGRNO00468 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AGRNO00468 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGRNO00468 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGRNO00468 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGRNO00468 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGRNO00468 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AGRNO00468 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGRNO00468 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGRNO00468 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGRNO00468 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AGRNO00468 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AGRNO00468 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGRNO00468 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGRNO00468 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGRNO00468 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGRNO00468 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGRNO00468 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGRNO00468 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGRNO00468 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGRNO00468 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGRNO00468 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGRNO00468 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGRNO00468 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AGRNO00468 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGRNO00468 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGRNO00468 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGRNO00468 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGRNO00468 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGRNO00468 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AGRNO00468 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGRNO00468 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AGRNO00468 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGRNO00468 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGRNO00468 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGRNO00468 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGRNO00468 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AGRNO00468 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGRNO00468 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGRNO00468 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGRNO00468 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGRNO00468 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGRNO00468 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGRNO00468 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGRNO00468 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGRNO00468 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGRNO00468 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGRNO00468 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGRNO00468 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AGRNO00468 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGRNO00468 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AGRNO00468 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGRNO00468 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGRNO00468 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGRNO00468 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGRNO00468 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGRNO00468 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRNO00468 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRNO00468 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRNO00468 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRNO00468 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRNO00468 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRNO00468 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRNO00468 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRNO00468 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRNO00468 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRNO00468 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRNO00468 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRNO00468 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRNO00468 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRNO00468 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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