Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3CDO00329 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms