Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIP1O00291 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIP1O00291 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HIP1O00291 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIP1O00291 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HIP1O00291 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIP1O00291 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIP1O00291 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIP1O00291 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIP1O00291 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HIP1O00291 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIP1O00291 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIP1O00291 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIP1O00291 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIP1O00291 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIP1O00291 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIP1O00291 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIP1O00291 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIP1O00291 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIP1O00291 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HIP1O00291 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIP1O00291 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIP1O00291 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIP1O00291 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HIP1O00291 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIP1O00291 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIP1O00291 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIP1O00291 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIP1O00291 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIP1O00291 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIP1O00291 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIP1O00291 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIP1O00291 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HIP1O00291 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIP1O00291 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIP1O00291 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIP1O00291 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HIP1O00291 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIP1O00291 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIP1O00291 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIP1O00291 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIP1O00291 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIP1O00291 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIP1O00291 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIP1O00291 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIP1O00291 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIP1O00291 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIP1O00291 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIP1O00291 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIP1O00291 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIP1O00291 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIP1O00291 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIP1O00291 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIP1O00291 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIP1O00291 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIP1O00291 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIP1O00291 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIP1O00291 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIP1O00291 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIP1O00291 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIP1O00291 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIP1O00291 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIP1O00291 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIP1O00291 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIP1O00291 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIP1O00291 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIP1O00291 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIP1O00291 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIP1O00291 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIP1O00291 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIP1O00291 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIP1O00291 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIP1O00291 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HIP1O00291 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIP1O00291 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIP1O00291 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIP1O00291 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIP1O00291 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIP1O00291 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HIP1O00291 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIP1O00291 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIP1O00291 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIP1O00291 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIP1O00291 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIP1O00291 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIP1O00291 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIP1O00291 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIP1O00291 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIP1O00291 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIP1O00291 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIP1O00291 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIP1O00291 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIP1O00291 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIP1O00291 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIP1O00291 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIP1O00291 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIP1O00291 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIP1O00291 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIP1O00291 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIP1O00291 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms