Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms