Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERVV-1B6SEH8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms