Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NOTOA8MTQ0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NOTOA8MTQ0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms