Protein–RNA interactions for Protein: A8MPX8

PP2D1, Protein phosphatase 2C-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PP2D1A8MPX8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PP2D1A8MPX8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms