Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRRM3A6NNA2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRRM3A6NNA2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms