Protein–RNA interactions for Protein: A6NHQ4

EPOP, Elongin BC and Polycomb repressive complex 2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPOPA6NHQ4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EPOPA6NHQ4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPOPA6NHQ4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EPOPA6NHQ4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPOPA6NHQ4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPOPA6NHQ4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPOPA6NHQ4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPOPA6NHQ4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPOPA6NHQ4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPOPA6NHQ4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPOPA6NHQ4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms