Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6L9A6NEM1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L9A6NEM1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms