Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms